En Inde, un scientifique de renom cherche à comprendre pourquoi certaines personnes possèdent des capacités extraordinaires. Il y a en effet, sur Terre, plusieurs personnes qui possèdent des pouvoirs. Heroes va suivre le quotidien de certains d'entre eux. On retrouve par exemple la pom-pom girl incassable, le jeune New yorkais qui croit pouvoir voler, le policier qui peut lire dans les pensées ou encore le Japonais qui contrôle le temps... Chacun d'entre eux essaie de faire, tant bien que mal, face à ses nouvelles capacités et tente d'en convaincre son entourage. Ils vont également devoir faire face à leur destinée : sauver le monde.